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首页 > 质粒载体 > 枯草杆菌载体 > pJMP1枯草编辑质粒
pJMP1枯草编辑质粒
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pJMP1枯草编辑质粒
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基本信息
  • 产品名称: pJMP1枯草编辑质粒
  • 产品编号: P2504
  • 规格: 10μl质粒/300μl菌液
  • 原核抗性: 氨苄青霉素Amp
  • 筛选标记: 红霉素Erm
  • 克隆菌株: 大肠杆菌DH5α
  • 培养条件: LB培养基/37℃
  • 表达宿主: 枯草杆菌
  • 质粒简介:        pJMP1质粒是一个枯草杆菌基因编辑质粒。Bacillus subtilis dCas9 expression vector; integrates into lacA/ganA。dcas9 was PCR-amplified from pdCas9-bacteria (Addgene #44249) using primers containing BamHI-compatible BsaI sites, digested with BsaI, then ligated into plasmid pAX01 digested with BamHI to generate pJMP1。

    A Comprehensive, CRISPR-based Functional Analysis of Essential Genes in Bacteria. 
    Peters JM, Colavin A, Shi H, Czarny TL, Larson MH, Wong S, Hawkins JS, Lu CH, Koo BM, Marta E, Shiver AL, Whitehead EH, Weissman JS, Brown ED, Qi LS, Huang KC, Gross CA
    Cell. 2016 Jun 2;165(6):1493-506. doi: 10.1016/j.cell.2016.05.003. Epub 2016 May 26. 
     PubMed  Journal
  • 质粒图谱:
  • 质粒序列: 点击查看序列
    LOCUS       Exported               12080 bp ds-DNA     circular SYN 14-MAY-2018
    DEFINITION  synthetic circular DNA
    FEATURES             Location/Qualifiers
         source          1..12080
                         /organism="synthetic DNA construct"
                         /mol_type="other DNA"
         CDS             1087..1278
                         /codon_start=1
                         /gene="rop"
                         /product="Rop protein, which maintains plasmids at low copy
                         number"
                         /note="rop"
                         /translation="MTKQEKTALNMARFIRSQTLTLLEKLNELDADEQADICESLHDHA
                         DELYRSCLARFGDDGENL"
         misc_feature    1380..1520
                         /note="bom"
                         /note="basis of mobility region from pBR322"
         rep_origin      complement(1706..2294)
                         /direction=LEFT
                         /note="ori"
                         /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                         replication"
         CDS             complement(2465..3325)
                         /codon_start=1
                         /gene="bla"
                         /product="beta-lactamase"
                         /note="AmpR"
                         /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                         related antibiotics"
                         /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                         ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                         PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                         EPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                         LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                         LIKHW"
         promoter        complement(3326..3430)
                         /gene="bla"
                         /note="AmpR promoter"
         CDS             complement(3541..3948)
                         /codon_start=1
                         /note="'lacA"
                         /translation="MKDYATVIDVKTASVEAVYQEDFYARTPAVTSHEYQQGKAYFIGA
                         RLEDQFQRDFYEGLITDLSLSPVFPVRHGKGVSVQARQDQDNDYIFVMNFTEEKQLVTF
                         DQSVKDIMTGDILSGDLTMEKYEVRIVVNTH"
         terminator      4074..4108
                         /note="lambda t0 terminator"
                         /note="minimal transcription terminator from phage lambda 
                         (Scholtissek and Grosse, 1987)"
         CDS             complement(4140..5264)
                         /codon_start=1
                         /note="bme xylR"
                         /translation="MNQKLILDEILKNSPVSRATLSEITGLNKSTVSSQVNTLLEKDFI
                         FEIGAGQSRGGRRPVMLVFNKNAGYSIGIDIGVDYLNGILTDLEGNIILEKTSDLSSSS
                         ASEVKEILFALIHGFVTHMPESPYGLVGIGICVPGLVDRHQQIIFMPNLNWNIKDLQFL
                         IESEFNVPVFVENEANAGAYGEKVFGMTKNYENIVYISINIGIGTGLVINNELYKGVQG
                         FSGEMGHMTIDFNGPKCSCGNRGCWELYASEKALLASLSKEEKNISRKEIVERANKNDV
                         EMLNALQNFGFYIGIGLTNILNTFDIEAVILRNHIIESHPIVLNTIKNEVSSRVHSHLD
                         NKCELLPSSLGKNAPALGAVSIVIDSFLSVTPIS"
         CDS             5580..9686
                         /codon_start=1
                         /product="catalytically dead mutant of the Cas9 
                         endonuclease from the Streptococcus pyogenes Type II 
                         CRISPR/Cas system"
                         /note="dCas9"
                         /note="RNA-guided DNA-binding protein that lacks 
                         endonuclease activity due to the D10A mutation in the RuvC 
                         catalytic domain and the H840A mutation in the HNH 
                         catalytic domain"
                         /translation="MDKKYSIGLAIGTNSVGWAVITDEYKVPSKKFKVLGNTDRHSIKK
                         NLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEES
                         FLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLVDSTDKADLRLIYLALAHMIK
                         FRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASGVDAKAILSARLSKSRRL
                         ENLIAQLPGEKKNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQ
                         IGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNTEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVR
                         QQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLVKLNREDLL
                         RKQRTFDNGSIPHQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARG
                         NSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEY
                         FTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFD
                         SVEISGVEDRFNASLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDREMIEER
                         LKTYAHLFDDKVMKQLKRRRYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFM
                         QLIHDDSLTFKEDIQKAQVSGQGDSLHEHIANLAGSPAIKKGILQTVKVVDELVKVMGR
                         HKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLY
                         LYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDAIVPQSFLKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVP
                         SEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKH
                         VAQILDSRMNTKYDENDKLIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYL
                         NAVVGTALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKYFFYSNIMNFFKT
                         EITLANGEIRKRPLIETNGETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGGFSK
                         ESILPKRNSDKLIARKKDWDPKKYGGFDSPTVAYSVLVVAKVEKGKSKKLKSVKELLGI
                         TIMERSSFEKNPIDFLEAKGYKEVKKDLIIKLPKYSLFELENGRKRMLASAGELQKGNE
                         LALPSKYVNFLYLASHYEKLKGSPEDNEQKQLFVEQHKHYLDEIIEQISEFSKRVILAD
                         ANLDKVLSAYNKHRDKPIREQAENIIHLFTLTNLGAPAAFKYFDTTIDRKRYTSTKEVL
                         DATLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD"
         terminator      9710..9781
                         /note="rrnB T1 terminator"
                         /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB 
                         gene"
         terminator      9797..9824
                         /note="T7Te terminator"
                         /note="phage T7 early transcription terminator"
         promoter        complement(9899..10003)
                         /gene="bla"
                         /note="AmpR promoter"
         CDS             10382..11119
                         /codon_start=1
                         /note="Erm"
                         /translation="MNKNIKYSQNFLTSEKVLNQIIKQLNLKETDTVYEIGTGKGHLTT
                         KLAKISKQVTSIELDSHLFNLSSEKLKLNTRVTLIHQDILQFQFPNKQRYKIVGSIPYH
                         LSTQIIKKVVFESHASDIYLIVEEGFYKRTLDIHRTLGLLLHTQVSIQQLLKLPAECFH
                         PKPKVNSVLIKLTRHTTDVPDKYWKLYTYFVSKWVNREYRQLFTKNQFHQAMKHAKVNN
                         LSTVTYEQVLSIFNSYLLFNGRK"
         terminator      11289..11375
                         /gene="Escherichia coli rrnB"
                         /note="rrnB T1 terminator"
                         /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB 
                         gene"
         terminator      11394..11421
                         /note="rrnB T2 terminator"
                         /note="transcription terminator T2 from the E. coli rrnB 
                         gene"
         terminator      11501..11535
                         /note="lambda t0 terminator"
                         /note="minimal transcription terminator from phage lambda 
                         (Scholtissek and Grosse, 1987)"
         CDS             complement(11559..12074)
                         /codon_start=1
                         /note="lacA'"
                         /translation="MSKLEKTHVTKAKFMLHGGDYNPDQWLDRPDILADDIKLMKLSHT
                         NTFSVGIFAWSALEPEEGVYQFEWLDDIFERIHSIGGRVILATPSGARPAWLSQTYPEV
                         LRVNASRVKQLHGGRHNHCLTSKVYREKTRHINRLLAERYGHHPALLMWHISNEYGGDC
                         HCESMRPL"
    ORIGIN
            1 atcctgatat tgtctgcatt tgcgccggag caaaccaaaa acctggtgag acacgccttg
           61 aattagtaga aaagaacttg aagattttca aaggcatcgt tagtgaagtc atggcgagcg
          121 gatttgacgg cattttctta gtcgcgacgc gaggctggat ggccttcccc attatgattc
          181 ttctcgcttc cggcggcatc gggatgcccg cgttgcaggc catgctgtcc aggcaggtag
          241 atgacgacca tcagggacag cttcaaggat cgctcgcggc tcttaccagc ctaacttcga
          301 tcactggacc gctgatcgtc acggcgattt atgccgcctc ggcgagcaca tggaacgggt
          361 tggcatggat tgtaggcgcc gccctatacc ttgtctgcct ccccgcgttg cgtcgcggtg
          421 catggagccg ggccacctcg acctgaatgg aagccggcgg cacctcgcta acggattcac
          481 cactccaaga attggagcca atcaattctt gcggagaact gtgaatgcgc aaaccaaccc
          541 ttggcagaac atatccatcg cgtccgccat ctccagcagc cgcacgcggc gcatctcggg
          601 cagcgttggg tcctggccac gggtgcgcat gatcgtgctc ctgtcgttga ggacccggct
          661 aggctggcgg ggttgcctta ctggttagca gaatgaatca ccgatacgcg agcgaacgtg
          721 aagcgactgc tgctgcaaaa cgtctgcgac ctgagcaaca acatgaatgg tcttcggttt
          781 ccgtgtttcg taaagtctgg aaacgcggaa gtcagcgccc tgcaccatta tgttccggat

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