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pGTQL1211YN/pEarleyGate201-YN植物BIFC双分子荧光质粒
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pGTQL1211YN/pEarleyGate201-YN植物BIFC双分子荧光质粒
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基本信息
产品名称:
pGTQL1211YN/pEarleyGate201-YN植物BIFC双分子荧光质粒
产品编号:
P1659
规格:
10μl质粒/300μl菌液
原核抗性:
卡那霉素Kan
筛选标记:
博来霉素Zeo
克隆菌株:
大肠杆菌DB3.1
培养条件:
37℃
质粒简介:
pGTQL1211YN/pEarleyGate201-YN是一个GateWay法的植物BIFC双分子荧光质粒。
质粒图谱:
质粒序列:
点击查看序列
LOCUS Exported 12321 bp ds-DNA circular SYN 03-DEC-2017
DEFINITION synthetic circular DNA
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..12321
/organism="synthetic DNA construct"
/mol_type="other DNA"
misc_feature 1..25
/label=LB T-DNA repeat
/note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"
terminator 111..363
/label=MAS terminator
/note="mannopine synthase terminator"
CDS complement(373..924)
/codon_start=1
/gene="Streptomyces hygroscopicus bar"
/product="phosphinothricin acetyltransferase"
/label=Zeo
/note="confers resistance to bialophos or phosphinothricin"
/translation="MSPERRPADIRRATEADMPAVCTIVNHYIETSTVNFRTEPQEPQE
WTDDLVRLRERYPWLVAEVDGEVAGIAYAGPWKARNAYDWTAESTVYVSPRHQRTGLGS
TLYTHLLKSLEAQGFKSVVAVIGLPNDPSVRMHEALGYAPRGMLRAAGFKHGNWHDVGF
WQLDFSLPVPPRPVLPVTEI"
promoter complement(930..1310)
/label=MAS promoter
/note="mannopine synthase promoter (Velten et al., 1984)"
promoter 2306..2651
/label=CaMV 35S promoter
/note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic
virus"
misc_feature 2681..2735
/label=TMV Omega
/note="translational enhancer from the tobacco mosaic virus
5'-leader sequence (Gallie et al., 1988)"
CDS 2740..2766
/codon_start=1
/product="HA (human influenza hemagglutinin) epitope tag"
/label=HA
/translation="YPYDVPDYA"
protein_bind 2770..2894
/gene="mutant version of attR"
/label=attR1
/bound_moiety="LR Clonase(TM)"
/note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"
promoter 2919..2949
/label=lac UV5 promoter
/note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"
CDS 3003..3662
/codon_start=1
/gene="cat"
/product="chloramphenicol acetyltransferase"
/label=CmR
/note="confers resistance to chloramphenicol"
/translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL
KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS
LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM
DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"
CDS 4004..4309
/codon_start=1
/gene="ccdB"
/product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"
/label=ccdB
/note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be
propagated in standard E. coli strains."
/translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRIVIPLASARLLSDK
VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"
protein_bind complement(4350..4474)
/gene="mutant version of attR"
/label=attR2
/bound_moiety="LR Clonase(TM)"
/note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"
CDS 4494..5012
/codon_start=1
/product="N-terminal fragment of mVenus for use in
bimolecular fluorescence complementation (BiFC) (Kodama and
Hu, 2010)"
/label=VN173
/translation="MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTL
KFICTTGKLPVPWPTLVTTFGYGLQCFARYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDD
GNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIK
VNFKIRHNIE"
terminator 5093..5800
/label=OCS terminator
/note="octopine synthase terminator"
misc_feature 6044..6068
/label=RB T-DNA repeat
/note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"
CDS 7368..7997
/codon_start=1
/product="stability protein from the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
/label=pVS1 StaA
/translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR
DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP
VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI
LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"
CDS 8431..9498
/codon_start=1
/product="replication protein from the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
/label=pVS1 RepA
/translation="GRKPSGPVQIGAALGDDLVEKLKAAQAAQRQRIEAEARPGESWQA
AADRIRKESRQPPAAGAPSIRKPPKGDEQPDFFVPMLYDVGTRDSRSIMDVAVFRLSKR
DRRAGEVIRYELPDGHVEVSAGPAGMASVWDYDLVLMAVSHLTESMNRYREGKGDKPGR
VFRPHVADVLKFCRRADGGKQKDDLVETCIRLNTTHVAMQRTKKAKNGRLVTVSEGEAL
ISRYKIVKSETGRPEYIEIELADWMYREITEGKNPDVLTVHPDYFLIDPGIGRFLYRLA
RRAAGKAEARWLFKTIYERSGSAGEFKKFCFTVRKLIGSNDLPEYDLKEEAGQAGPILV
MRYRNLIEGEASAGS"
rep_origin 9564..9758
/label=pVS1 oriV
/note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
misc_feature 10102..10242
/label=bom
/note="basis of mobility region from pBR322"
rep_origin complement(10428..11016)
/direction=LEFT
/label=ori
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
CDS complement(11103..11897)
/codon_start=1
/gene="aphA-3"
/product="aminoglycoside phosphotransferase"
/label=KanR
/note="confers resistance to kanamycin"
/translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM
TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED
EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT
PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA
FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"
ORIGIN
1 tggcaggata tattgtggtg taaacaaatt gacgcttaga caacttaata acacattgcg
61 gacgttttta atgtactgaa ttaacgccga attaattcga gctcggatct gataatttat
121 ttgaaaattc ataagaaaag caaacgttac atgaattgat gaaacaatac aaagacagat
181 aaagccacgc acatttagga tattggccga gattactgaa tattgagtaa gatcacggaa
241 tttctgacag gagcatgtct tcaattcagc ccaaatggca gttgaaatac tcaaaccgcc
301 ccatatgcag gagcggatca ttcattgttt gtttggttgc ctttgccaac atgggagtcc
361 aagattctgc agtcaaatct cggtgacggg caggaccgga cggggcggta ccggcaggct
421 gaagtccagc tgccagaaac ccacgtcatg ccagttcccg tgcttgaagc cggccgcccg
481 cagcatgccg cggggggcat atccgagcgc ctcgtgcatg cgcacgctcg ggtcgttggg
541 cagcccgatg acagcgacca cgctcttgaa gccctgtgcc tccagggact tcagcaggtg
601 ggtgtagagc gtggagccca gtcccgtccg ctggtggcgg ggggagacgt acacggtcga
661 ctcggccgtc cagtcgtagg cgttgcgtgc cttccagggg cccgcgtagg cgatgccggc
721 gacctcgccg tccacctcgg cgacgagcca gggatagcgc tcccgcagac ggacgaggtc
781 gtccgtccac tcctgcggtt cctgcggctc ggtacggaag ttgaccgtgc ttgtctcgat
841 gtagtggttg acgatggtgc agaccgccgg catgtccgcc tcggtggcac ggcggatgtc
901 ggccgggcgt cgttctgggc tcatcgattc gatttggtgt atcgagattg gttatgaaat
961 tcagatgcta gtgtaatgta ttggtaattt gggaagatat aataggaagc aaggctattt
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