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基本信息
产品名称:
pEarleyGate302
产品编号:
P1417
规格:
10μl质粒/300μl菌液
质粒图谱:
质粒序列:
点击查看序列
LOCUS Exported 10376 bp ds-DNA circular SYN 24-SEP-2017
DEFINITION synthetic circular DNA
ACCESSION .
VERSION .
KEYWORDS .
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 10376)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
JOURNAL Exported Sep 24, 2017 from MiaoLingPlasmid
http://www.miaolingbio.com
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..10376
/organism="synthetic DNA construct"
/mol_type="other DNA"
misc_feature 3..27
/label=LB T-DNA repeat
/note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"
terminator 113..365
/label=MAS terminator
/note="mannopine synthase terminator"
CDS complement(375..926)
/codon_start=1
/gene="Streptomyces hygroscopicus bar"
/product="phosphinothricin acetyltransferase"
/label=Bar
/note="confers resistance to bialophos or phosphinothricin"
/translation="MSPERRPADIRRATEADMPAVCTIVNHYIETSTVNFRTEPQEPQE
WTDDLVRLRERYPWLVAEVDGEVAGIAYAGPWKARNAYDWTAESTVYVSPRHQRTGLGS
TLYTHLLKSLEAQGFKSVVAVIGLPNDPSVRMHEALGYAPRGMLRAAGFKHGNWHDVGF
WQLDFSLPVPPRPVLPVTEI"
promoter complement(932..1312)
/label=MAS promoter
/note="mannopine synthase promoter (Velten et al., 1984)"
protein_bind 1364..1488
/gene="mutant version of attR"
/label=attR1
/bound_moiety="LR Clonase(TM)"
/note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"
promoter 1513..1543
/label=lac UV5 promoter
/note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"
CDS 1597..2256
/codon_start=1
/gene="cat"
/product="chloramphenicol acetyltransferase"
/label=CmR
/note="confers resistance to chloramphenicol"
/translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL
KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS
LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM
DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"
CDS 2598..2903
/codon_start=1
/gene="ccdB"
/product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"
/label=ccdB
/note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be
propagated in standard E. coli strains."
/translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK
VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"
protein_bind complement(2944..3068)
/gene="mutant version of attR"
/label=attR2
/bound_moiety="LR Clonase(TM)"
/note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"
CDS 3070..3093
/codon_start=1
/product="FLAG(R) epitope tag, followed by an enterokinase
cleavage site"
/label=FLAG
/translation="DYKDDDDK"
terminator 3147..3854
/label=OCS terminator
/note="octopine synthase terminator"
misc_feature 4098..4122
/label=RB T-DNA repeat
/note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"
CDS 5422..6051
/codon_start=1
/product="stability protein from the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
/label=pVS1 StaA
/translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR
DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP
VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI
LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"
CDS 6480..7553
/codon_start=1
/product="replication protein from the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
/label=pVS1 RepA
/translation="MSGRKPSGPVQIGAALGDDLVEKLKAAQAAQRQRIEAEARPGESW
QAAADRIRKESRQPPAAGAPSIRKPPKGDEQPDFFVPMLYDVGTRDSRSIMDVAVFRLS
KRDRRAGEVIRYELPDGHVEVSAGPAGMASVWDYDLVLMAVSHLTESMNRYREGKGDKP
GRVFRPHVADVLKFCRRADGGKQKDDLVETCIRLNTTHVAMQRTKKAKNGRLVTVSEGE
ALISRYKIVKSETGRPEYIEIELADWMYREITEGKNPDVLTVHPDYFLIDPGIGRFLYR
LARRAAGKAEARWLFKTIYERSGSAGEFKKFCFTVRKLIGSNDLPEYDLKEEAGQAGPI
LVMRYRNLIEGEASAGS"
rep_origin 7619..7813
/label=pVS1 oriV
/note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid
pVS1 (Heeb et al., 2000)"
misc_feature 8157..8297
/label=bom
/note="basis of mobility region from pBR322"
rep_origin complement(8483..9071)
/direction=LEFT
/label=ori
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
CDS complement(9158..9952)
/codon_start=1
/gene="aphA-3"
/product="aminoglycoside phosphotransferase"
/label=KanR
/note="confers resistance to kanamycin"
/translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM
TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED
EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT
PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA
FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"
ORIGIN
1 gctggcagga tatattgtgg tgtaaacaaa ttgacgctta gacaacttaa taacacattg
61 cggacgtttt taatgtactg aattaacgcc gaattaattc gagctcggat ctgataattt
121 atttgaaaat tcataagaaa agcaaacgtt acatgaattg atgaaacaat acaaagacag
181 ataaagccac gcacatttag gatattggcc gagattactg aatattgagt aagatcacgg
241 aatttctgac aggagcatgt cttcaattca gcccaaatgg cagttgaaat actcaaaccg
301 ccccatatgc aggagcggat cattcattgt ttgtttggtt gcctttgcca acatgggagt
361 ccaagattct gcagtcaaat ctcggtgacg ggcaggaccg gacggggcgg taccggcagg
421 ctgaagtcca gctgccagaa acccacgtca tgccagttcc cgtgcttgaa gccggccgcc
481 cgcagcatgc cgcggggggc atatccgagc gcctcgtgca tgcgcacgct cgggtcgttg
541 ggcagcccga tgacagcgac cacgctcttg aagccctgtg cctccaggga cttcagcagg
601 tgggtgtaga gcgtggagcc cagtcccgtc cgctggtggc ggggggagac gtacacggtc
661 gactcggccg tccagtcgta ggcgttgcgt gccttccagg ggcccgcgta ggcgatgccg
721 gcgacctcgc cgtccacctc ggcgacgagc cagggatagc gctcccgcag acggacgagg
781 tcgtccgtcc actcctgcgg ttcctgcggc tcggtacgga agttgaccgt gcttgtctcg
841 atgtagtggt tgacgatggt gcagaccgcc ggcatgtccg cctcggtggc acggcggatg
901 tcggccgggc gtcgttctgg gctcatcgat tcgatttggt gtatcgagat tggttatgaa
961 attcagatgc tagtgtaatg tattggtaat ttgggaagat ataataggaa gcaaggctat
1021 ttatccattt ctgaaaaggc gaaatggcgt caccgcgagc gtcacgcgca ttccgttctt
1081 gctgtaaagc gttgtttggt acacttttga ctagcgaggc ttggcgtgtc agcgtatcta
1141 ttcaaaagtc gttaatggct gcggatcaag aaaaagttgg aatagaaaca gaatacccgc
1201 gaaattcagg cccggttgcc atgtcctaca cgccgaaata aacgaccaaa ttagtagaaa
1261 aataaaaact gactcggata cttacgtcac gtcttgcgca ctgatttgaa aaatctcaga
1321 attgaattct gcagtcgacg gtaccgcggg cccgggatca tcaacaagtt tgtacaaaaa
1381 agctgaacga gaaacgtaaa atgatataaa tatcaatata ttaaattaga ttttgcataa
1441 aaaacagact acataatact gtaaaacaca acatatccag tcatattggc ggccgcatta
1501 ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc ggctcgtata atgtgtggat tttgagttag
1561 gatccgtcga gattttcagg agctaaggaa gctaaaatgg agaaaaaaat cactggatat
1621 accaccgttg atatatccca atggcatcgt aaagaacatt ttgaggcatt tcagtcagtt
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