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商品简介
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基本信息
产品名称:
pJYS3_ΔcrtYf大肠敲除质粒
产品编号:
P1827
规格:
10μl质粒/300μl菌液
原核抗性:
卡那霉素Kan
克隆菌株:
大肠杆菌Stbl3
培养条件:
37℃
质粒简介:
参考文献:
CRISPR-Cpf1 assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum.
质粒图谱:
质粒序列:
点击查看序列
LOCUS Exported 11982 bp ds-DNA circular SYN 21-JAN-2018
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..11982
/organism="synthetic DNA construct"
/mol_type="other DNA"
rep_origin 2672..2894
/label=pSC101 ori
/note="low-copy replication origin that requires the Rep101
protein"
CDS 2942..3892
/codon_start=1
/gene="rep101"
/product="RepA protein needed for replication with the
pSC101 origin"
/label=Rep101
/translation="MSELVVFKANELAISRYDLTEHETKLILCCVALLNPTIENPTRKE
RTVSFTYNQYAQMMNISRENAYGVLAKATRELMTRTVEIRNPLVKGFEIFQWTNYAKFS
SEKLELVFSEEILPYLFQLKKFIKYNLEHVKSFENKYSMRIYEWLLKELTQKKTHKANI
EISLDEFKFMLMLENNYHEFKRLNQWVLKPISKDLNTYSNMKLVVDKRGRPTDTLIFQV
ELDRQMDLVTELENNQIKMNGDKIPTTITSDSYLHNGLRKTLHDALTAKIQLTSFEAKF
LSDMQSKHDLNGSFSWLTQKQRTTLENILAKYGRI"
terminator 6149..6234
/gene="Escherichia coli rrnB"
/label=rrnB T1 terminator
/note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB
gene"
terminator 6326..6353
/label=rrnB T2 terminator
/note="transcription terminator T2 from the E. coli rrnB
gene"
CDS complement(6397..10299)
/codon_start=1
/label=Cpf1
/translation="MSIYQEFVNKYSLSKTLRFELIPQGKTLENIKARGLILDDEKRAK
DYKKAKQIIDKYHQFFIEEILSSVCISEDLLQNYSDVYFKLKKSDDDNLQKDFKSAKDT
IKKQISEYIKDSEKFKNLFNQNLIDAKKGQESDLILWLKQSKDNGIELFKANSDITDID
EALEIIKSFKGWTTYFKGFHENRKNVYSSNDIPTSIIYRIVDDNLPKFLENKAKYESLK
DKAPEAINYEQIKKDLAEELTFDIDYKTSEVNQRVFSLDEVFEIANFNNYLNQSGITKF
NTIIGGKFVNGENTKRKGINEYINLYSQQINDKTLKKYKMSVLFKQILSDTESKSFVID
KLEDDSDVVTTMQSFYEQIAAFKTVEEKSIKETLSLLFDDLKAQKLDLSKIYFKNDKSL
TDLSQQVFDDYSVIGTAVLEYITQQIAPKNLDNPSKKEQELIAKKTEKAKYLSLETIKL
ALEEFNKHRDIDKQCRFEEILANFAAIPMIFDEIAQNKDNLAQISIKYQNQGKKDLLQA
SAEDDVKAIKDLLDQTNNLLHKLKIFHISQSEDKANILDKDEHFYLVFEECYFELANIV
PLYNKIRNYITQKPYSDEKFKLNFENSTLANGWDKNKEPDNTAILFIKDDKYYLGVMNK
KNNKIFDDKAIKENKGEGYKKIVYKLLPGANKMLPKVFFSAKSIKFYNPSEDILRIRNH
STHTKNGSPQKGYEKFEFNIEDCRKFIDFYKQSISKHPEWKDFGFRFSDTQRYNSIDEF
YREVENQGYKLTFENISESYIDSVVNQGKLYLFQIYNKDFSAYSKGRPNLHTLYWKALF
DERNLQDVVYKLNGEAELFYRKQSIPKKITHPAKEAIANKNKDNPKKESVFEYDLIKDK
RFTEDKFFFHCPITINFKSSGANKFNDEINLLLKEKANDVHILSIDRGERHLAYYTLVD
GKGNIIKQDTFNIIGNDRMKTNYHDKLAAIEKDRDSARKDWKKINNIKEMKEGYLSQVV
HEIAKLVIEYNAIVVFEDLNFGFKRGRFKVEKQVYQKLEKMLIEKLNYLVFKDNEFDKT
GGVLRAYQLTAPFETFKKMGKQTGIIYYVPAGFTSKICPVTGFVNQLYPKYESVSKSQE
FFSKFDKICYNLDKGYFEFSFDYKNFGDKAAKGKWTIASFGSRLINFRNSDKNHNWDTR
EVYPTKELEKLLKDYSIEYGHGECIKAAICGESDKKFFAKLTSVLNTILQMRNSKTGTE
LDYLISPVADVNGNFFDSRQAPKNMPQDADANGAYHIGLKGLMLLGRIKNNQEGKKLNL
VIKNEEYFEFVQNRNN"
CDS complement(10392..11186)
/codon_start=1
/gene="aph(3')-II (or nptII)"
/product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"
/label=Kan
/note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418
(Geneticin(R))"
/translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP
VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS
SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ
GLAPAELFARLKARMPDGEDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA
LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"
ORIGIN
1 tcctcacgta gtgccaaagg aacgcgtgcg gtgaccacga cgggcttagc ctttgcctgc
61 gcttctagtg cttcgatggt ggcttgtgcc tgcgcttgct gcgcctgtag tgcctgttga
121 gcttcttgta gttgctgttc tagctgtgcc ttggttgcca tgctttaaga ctctagtagc
181 tttcctgcga tatgtcatgc gcatgcgtag caaacattgt cctgcaactc attcattatg
241 tgcagtgctc ctgttactag tcgtacatac tcatatttac ctagtctgca tgcagtgcat
301 gcacatgcag tcatgtcgtg ctaatgtgta aaacatgtac atgcagattg ctgggggtgc
361 agggggcgga gccaccctgt ccatgcgggg tgtggggctt gccccgccgg tacagacagt
421 gagcaccggg gcacctagtc gcggataccc cccctaggta tcggacacgt aaccctccca
481 tgtcgatgca aatctttaac attgagtacg ggtaagctgg cacgcatagc caagctaggc
541 ggccaccaaa caccactaaa aattaatagt ccctagacaa gacaaacccc cgtgcgagct
601 accaactcat atgcacgggg gccacataac ccgaaggggt ttcaattgac aaccatagca
661 ctagctaaga caacgggcac aacacccgca caaactcgca ctgcgcaacc ccgcacaaca
721 tcgggtctag gtaacactga aatagaagtg aacacctcta aggaaccgca ggtcaatgag
781 ggttctaagg tcactcgcgc tagggcgtgg cgtaggcaaa acgtcatgta caagatcacc
841 aatagtaagg ctctggcggg gtgccatagg tggcgcaggg acgaagctgt tgcggtgtcc
901 tggtcgtcta acggtgcttc gcagtttgag ggtctgcaaa actctcactc tcgctggggg
961 tcatctctgg ctgaattgga agtcatgggc gaacgccgca ttgagctggc tattgctact
1021 aagaatcact tggcggcggg tggcgcgctc atgatgtttg tgggcactgt tcgacacaac
1081 cgctcacagt catttgcgca ggttgaagcg ggtattaaga ctgcgtactc ttcgatggtg
1141 aaaacatctc agtggaagaa agaacgtgca cggtacgggg tggagcacac ctatagtgac
1201 tatgaggtca cagactcttg ggcgaacggt tggcacttgc accgcaacat gctgttgttc
1261 ttggatcgtc cactgtctga cgatgaactc aaggcgtttg aggattccat gttttcccgc
1321 tggtctgctg gtgtggttaa ggccggtatg gacgcgccac tgcgtgagca cggggtcaaa
1381 cttgatcagg tgtctacctg gggtggagac gctgcgaaaa tggcaaccta cctcgctaag
1441 ggcatgtctc aggaactgac tggctccgct actaaaaccg cgtctaaggg gtcgtacacg
1501 ccgtttcaga tgttggatat gttggccgat caaagcgacg ccggcgagga tatggacgct
1561 gttttggtgg ctcggtggcg tgagtatgag gttggttcta aaaacctgcg ttcgtcctgg
1621 tcacgtgggg ctaagcgtgc tttgggcatt gattacatag acgctgatgt acgtcgtgaa
1681 atggaagaag aactgtacaa gctcgccggt ctggaagcac cggaacgggt cgaatcaacc
1741 cgcgttgctg ttgctttggt gaagcccgat gattggaaac tgattcagtc tgatttcgcg
1801 gttaggcagt acgttctcga ttgcgtggat aaggctaagg acgtggccgc tgcgcaacgt
1861 gtcgctaatg aggtgctggc aagtctgggt gtggattcca ccccgtgcat gatcgttatg
1921 gatgatgtgg acttggacgc ggttctgcct actcatgggg acgctactaa gcgtgatctg
1981 aatgcggcgg tgttcgcggg taatgagcag actattcttc gcacccacta aaagcggcat
2041 aaaccccgtt cgatattttg tgcgatgaat ttatggtcaa tgtcgcgggg gcaaactatg
2101 atgggtcttg ttgttggcgt cccggagcgt aaaggatcta ggtgaagatc ctttttgata
2161 atctcatgac caaaatccct taacgtgagt tttcgttcca ctgagcgtca gaccttgatg
2221 ataccgctgc cttactgggt gcattagcca gtctgaatga cctgtcacgg gataatccga
2281 agtggtcaga ctggaaaatc agagggcagg aactgctgaa cagcaaaaag tcagatagca
2341 ccacatagca gacccgccat aaaacgccct gagaagcccg tgacgggctt ttcttgtatt
2401 atgggtagtt tccttgcatg aatccataaa aggcgcctgt agtgccattt acccccattc
2461 actgccagag ccgtgagcgc agcgaactga atgtcacgaa aaagacagcg actcaggtgc
2521 ctgatggtcg gagacaaaag gaatattcag cgatttgccc gagcttgcga gggtgctact
2581 taagccttta gggttttaag gtctgttttg tagaggagca aacagcgttt gcgacatcct
2641 tttgtaatac tgcggaactg actaaagtag tgagttatac acagggctgg gatctattct
2701 ttttatcttt ttttattctt tctttattct ataaattata accacttgaa tataaacaaa
2761 aaaaacacac aaaggtctag cggaatttac agagggtcta gcagaattta caagttttcc
2821 agcaaaggtc tagcagaatt tacagatacc cacaactcaa aggaaaagga ctagtaatta
2881 tcattgacta gcccatctca attggtatag tgattaaaat cacctagacc aattgagatg
2941 tatgtctgaa ttagttgttt tcaaagcaaa tgaactagcg attagtcgct atgacttaac
3001 ggagcatgaa accaagctaa ttttatgctg tgtggcacta ctcaacccca cgattgaaaa
3061 ccctacaagg aaagaacgga cggtatcgtt cacttataac caatacgctc agatgatgaa
3121 catcagtagg gaaaatgctt atggtgtatt agctaaagca accagagagc tgatgacgag
3181 aactgtggaa atcaggaatc ctttggttaa aggctttgag attttccagt ggacaaacta
3241 tgccaagttc tcaagcgaaa aattagaatt agtttttagt gaagagatat tgccttatct
3301 tttccagtta aaaaaattca taaaatataa tctggaacat gttaagtctt ttgaaaacaa
3361 atactctatg aggatttatg agtggttatt aaaagaacta acacaaaaga aaactcacaa
3421 ggcaaatata gagattagcc ttgatgaatt taagttcatg ttaatgcttg aaaataacta
3481 ccatgagttt aaaaggctta accaatgggt tttgaaacca ataagtaaag atttaaacac
3541 ttacagcaat atgaaattgg tggttgataa gcgaggccgc ccgactgata cgttgatttt
3601 ccaagttgaa ctagatagac aaatggatct cgtaaccgaa cttgagaaca accagataaa
3661 aatgaatggt gacaaaatac caacaaccat tacatcagat tcctacctac ataacggact
3721 aagaaaaaca ctacacgatg ctttaactgc aaaaattcag ctcaccagtt ttgaggcaaa
3781 atttttgagt gacatgcaaa gtaagcatga tctcaatggt tcgttctcat ggctcacgca
3841 aaaacaacga accacactag agaacatact ggctaaatac ggaaggatct gaggttctta
3901 tggctcttgt atctatcagt gaagcatcaa gactaacaaa caaaagtaga acaactgttc
3961 accgggcccg tgggtggcta ggcaagttac agaactgatc ggataaaagc agagttatat
4021 ctgatgaatt gctattagca gtatcgttat cacagcacca acaaagtagt tcagccacag
4081 gaaaactttc caactgcgat tagcctgttc acaactggca tctgtaatgt tccaaaatcg
4141 tgcggcatta aatacgtaag ttagaatcgc aatcccgatg atccacgccg gattaggcaa
4201 agtagtgact aacacagcag ctagtaaata aagtactact gaaagccgaa tggctccacg
4261 cgccccaatt acagtggcaa ttgagctcag attagcttcc cggtctgcat taacatcctg
4321 tactgctcca aggatctgac tggccatgcc ccacaagaaa aaggatccca gtgctatcca
4381 catcgctgct gaaggagatg ttccagtgat cgttgcaccg attaatgcag gtgaagtgaa
4441 gtgagtagaa gatgttagag catcgataaa ggggcgttct ttaaaacgca atttcggtgc
4501 tgaataagca atcactgcta gcactgagag tgtcagccat aaagacgaca tccaggtgcc
4561 aaatatgaaa agaataacta ggaaaggaat tgttgagata gccgaggccc ataacagtgt
4621 gctgtgggaa cttttcggta gcacggcccc ctcgacgccg cctttgcggg gattacgcat
4681 atcagattcg taatcaaaaa catcgttgat accatacatg gcgatgttat acgggataag
4741 aaaaaatacg atgcctagcc aaaacagcca gtcaatctct cctgcattta ataggtaggc
4801 cagaccaaag gggtaggcgg tattgatcca gctaatgggg cgagatgaca atagaattag
4861 tcttattttt tccatcatga ctacggcttt tctggctc
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