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pLKO.1-EGFP-Puro慢病毒干扰RNA质粒
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pLKO.1-EGFP-Puro慢病毒干扰RNA质粒
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商品简介
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基本信息
产品名称:
pLKO.1-EGFP-Puro慢病毒干扰RNA质粒
产品编号:
P1717
规格:
10μl质粒/300μl菌液
原核抗性:
氨苄青霉素Amp
筛选标记:
嘌呤霉素Puro,绿色荧光蛋白EGFP
克隆菌株:
大肠杆菌Stbl3
培养条件:
37℃
表达宿主:
哺乳细胞
质粒简介:
pLKO.1-EGFP-Puro是一个哺乳细胞慢病毒干扰RNA质粒。
质粒图谱:
质粒序列:
点击查看序列
LOCUS Exported 8301 bp ds-DNA circular SYN 14-DEC-2017
DEFINITION synthetic circular DNA
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..8301
/organism="synthetic DNA construct"
/mol_type="other DNA"
promoter 7..507
/label=hPGK promoter
/note="human phosphoglycerate kinase 1 promoter"
CDS 529..1128
/codon_start=1
/gene="pac from Streptomyces alboniger"
/product="puromycin N-acetyltransferase"
/label=PuroR
/note="confers resistance to puromycin"
/translation="MTEYKPTVRLATRDDVPRAVRTLAAAFADYPATRHTVDPDRHIER
VTELQELFLTRVGLDIGKVWVADDGAAVAVWTTPESVEAGAVFAEIGPRMAELSGSRLA
AQQQMEGLLAPHRPKEPAWFLATVGVSPDHQGKGLGSAVVLPGVEAAERAGVPAFLETS
APRNLPFYERLGFTVTADVEVPEGPRTWCMTRKPGA"
LTR 1256..1489
/label=3' LTR (Delta-U3)
/note="self-inactivating 3' long terminal repeat (LTR) from
HIV-1"
polyA_signal 1561..1682
/label=SV40 poly(A) signal
/note="SV40 polyadenylation signal"
rep_origin 1722..1857
/label=SV40 ori
/note="SV40 origin of replication"
rep_origin 2064..2519
/direction=RIGHT
/label=f1 ori
/note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow
indicates direction of (+) strand synthesis"
promoter 2545..2649
/gene="bla"
/label=AmpR promoter
CDS 2650..3510
/codon_start=1
/gene="bla"
/product="beta-lactamase"
/label=AmpR
/note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
related antibiotics"
/translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
LIKHW"
rep_origin 3681..4269
/direction=RIGHT
/label=ori
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
promoter 4738..4964
/label=RSV promoter
/note="Rous sarcoma virus enhancer/promoter"
LTR 4965..5145
/label=5' LTR (truncated)
/note="truncated 5' long terminal repeat (LTR) from HIV-1"
misc_feature 5192..5317
/label=HIV-1 Psi
/note="packaging signal of human immunodeficiency virus
type 1"
misc_feature 5810..6043
/label=RRE
/note="The Rev response element (RRE) of HIV-1 allows for
Rev-dependent mRNA export from the nucleus to the
cytoplasm."
promoter 6570..6810
/label=U6 promoter
/note="RNA polymerase III promoter for human U6 snRNA"
enhancer 6832..7135
/label=CMV enhancer
/note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
promoter 7136..7339
/label=CMV promoter
/note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early
promoter"
regulatory 7368..7377
/regulatory_class="other"
/note="vertebrate consensus sequence for strong initiation
of translation (Kozak, 1987)"
CDS 7374..8093
/codon_start=1
/product="enhanced GFP"
/label=EGFP
/note="mammalian codon-optimized"
/translation="MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTL
KFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDD
GNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIK
VNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLL
EFVTAAGITLGMDELYK"
misc_feature 8132..8249
/label=cPPT/CTS
/note="central polypurine tract and central termination
sequence of HIV-1"
ORIGIN
1 ttggggttgc gccttttcca aggcagccct gggtttgcgc agggacgcgg ctgctctggg
61 cgtggttccg ggaaacgcag cggcgccgac cctgggtctc gcacattctt cacgtccgtt
121 cgcagcgtca cccggatctt cgccgctacc cttgtgggcc ccccggcgac gcttcctgct
181 ccgcccctaa gtcgggaagg ttccttgcgg ttcgcggcgt gccggacgtg acaaacggaa
241 gccgcacgtc tcactagtac cctcgcagac ggacagcgcc agggagcaat ggcagcgcgc
301 cgaccgcgat gggctgtggc caatagcggc tgctcagcag ggcgcgccga gagcagcggc
361 cgggaagggg cggtgcggga ggcggggtgt ggggcggtag tgtgggccct gttcctgccc
421 gcgcggtgtt ccgcattctg caagcctccg gagcgcacgt cggcagtcgg ctccctcgtt
481 gaccgaatca ccgacctctc tccccagggg gatccaccgg agcttaccat gaccgagtac
541 aagcccacgg tgcgcctcgc cacccgcgac gacgtcccca gggccgtacg caccctcgcc
601 gccgcgttcg ccgactaccc cgccacgcgc cacaccgtcg atccggaccg ccacatcgag
661 cgggtcaccg agctgcaaga actcttcctc acgcgcgtcg ggctcgacat cggcaaggtg
721 tgggtcgcgg acgacggcgc cgcggtggcg gtctggacca cgccggagag cgtcgaagcg
781 ggggcggtgt tcgccgagat cggcccgcgc atggccgagt tgagcggttc ccggctggcc
841 gcgcagcaac agatggaagg cctcctggcg ccgcaccggc ccaaggagcc cgcgtggttc
901 ctggccaccg tcggcgtctc gcccgaccac cagggcaagg gtctgggcag cgccgtcgtg
961 ctccccggag tggaggcggc cgagcgcgcc ggggtgcccg ccttcctgga gacctccgcg
1021 ccccgcaacc tccccttcta cgagcggctc ggcttcaccg tcaccgccga cgtcgaggtg
1081 cccgaaggac cgcgcacctg gtgcatgacc cgcaagcccg gtgcctgacg cccgccccac
1141 gacccgcagc gcccgaccga aaggagcgca cgaccccatg catcggtacc tttaagacca
1201 atgacttaca aggcagctgt agatcttagc cactttttaa aagaaaaggg gggactggaa
1261 gggctaattc actcccaacg aagacaagat ctgctttttg cttgtactgg gtctctctgg
1321 ttagaccaga tctgagcctg ggagctctct ggctaactag ggaacccact gcttaagcct
1381 caataaagct tgccttgagt gcttcaagta gtgtgtgccc gtctgttgtg tgactctggt
1441 aactagagat ccctcagacc cttttagtca gtgtggaaaa tctctagcag tagtagttca
1501 tgtcatctta ttattcagta tttataactt gcaaagaaat gaatatcaga gagtgagagg
1561 aacttgttta ttgcagctta taatggttac aaataaagca atagcatcac aaatttcaca
1621 aataaagcat ttttttcact gcattctagt tgtggtttgt ccaaactcat caatgtatct
1681 tatcatgtct ggctctagct atcccgcccc taactccgcc catcccgccc ctaactccgc
1741 ccagttccgc ccattctccg ccccatggct gactaatttt ttttatttat gcagaggccg
1801 aggccgcctc ggcctctgag ctattccaga agtagtgagg aggctttttt ggaggcctag
1861 ggacgtaccc aattcgccct atagtgagtc gtattacgcg cgctcactgg ccgtcgtttt
1921 acaacgtcgt gactgggaaa accctggcgt tacccaactt aatcgccttg cagcacatcc
1981 ccctttcgcc agctggcgta atagcgaaga ggcccgcacc gatcgccctt cccaacagtt
2041 gcgcagcctg aatggcgaat gggacgcgcc ctgtagcggc gcattaagcg cggcgggtgt
2101 ggtggttacg cgcagcgtga ccgctacact tgccagcgcc ctagcgcccg ctcctttcgc
2161 tttcttccct tcctttctcg ccacgttcgc cggctttccc cgtcaagctc taaatcgggg
2221 gctcccttta gggttccgat ttagtgcttt acggcacctc gaccccaaaa aacttgatta
2281 gggtgatggt tcacgtagtg ggccatcgcc ctgatagacg gtttttcgcc ctttgacgtt
2341 ggagtccacg ttctttaata gtggactctt gttccaaact ggaacaacac tcaaccctat
2401 ctcggtctat tcttttgatt tataagggat tttgccgatt tcggcctatt ggttaaaaaa
2461 tgagctgatt taacaaaaat ttaacgcgaa ttttaacaaa atattaacgc ttacaattta
2521 ggtggcactt ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt ctaaatacat
2581 tcaaatatgt atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata atattgaaaa
2641 aggaagagta tgagtattca acatttccgt gtcgccctta ttcccttttt tgcggcattt
2701 tgccttcctg tttttgctca cccagaaacg ctggtgaaag taaaagatgc tgaagatcag
2761 ttgggtgcac gagtgggtta catcgaactg gatctcaaca gcggtaagat ccttgagagt
2821 tttcgccccg aagaacgttt tccaatgatg agcactttta aagttctgct atgtggcgcg
2881 gtattatccc gtattgacgc cgggcaagag caactcggtc gccgcataca ctattctcag
2941 aatgacttgg ttgagtactc accagtcaca gaaaagcatc ttacggatgg catgacagta
3001 agagaattat gcagtgctgc cataaccatg agtgataaca ctgcggccaa cttacttctg
3061 acaacgatcg gaggaccgaa ggagctaacc gcttttttgc acaacatggg ggatcatgta
3121 actcgccttg atcgttggga accggagctg aatgaagcca taccaaacga cgagcgtgac
3181 accacgatgc ctgtagcaat ggcaacaacg ttgcgcaaac tattaactgg cgaactactt
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